Conosciuto anche come "southern Department", questo Box è stato inaugurato nella primavera del 2017 con l'obiettivo di servire principalmente il Mendrisioto e le zone di confine con le province di Como e Varese. Con i suoi 1200mq di superficie coperta ed oltre 3400mq di superficie outdoor, CrossFit Lugano Southern è il pù grande Box del Canton Ticino e tra i più grandi della Svizzera. Anche questo Box, come il "fratello" di Lugano con cui condivide anche parte dei trainer, fa parte del programma "Reebok Recognised Box"